Отделения центра:

Нейрохирургическое отделение № 1 (детское)

Нейрохирургическое отделение № 2 (сосудистое)

Нейрохирургическое отделение № 3 (спинальное)

Нейрохирургическое отделение № 4 (нейроокнологии)

Нейрохирургическое отделение № 5 (функциональное)

Приемно-консультативное отделение